Правовой основой выполнения Экономическим Судом СНГ функций Суда Евразийского экономического сообщества являются Решение Межгосударственного Совета Евразийского экономического сообщества об организации функционирования Суда Евразийского экономического сообщества от 27 апреля 2007 года № 123; Решение Совета глав государств СНГ о возложении на Экономический Суд СНГ функций Суда Евразийского экономического сообщества от 19 сентября 2003 года и Соглашение между Содружеством Независимых Государств и Евразийским экономическим сообществом о выполнении Экономическим Судом Содружества Независимых Государств функций Суда Евразийского экономического сообщества от 3 марта 2004 года (далее — Соглашение). Статут Суда Евразийского экономического сообщества.
В соответствии со статьей 1 Соглашения Экономический Суд СНГ временно, до формирования Суда ЕврАзЭС обеспечивает единообразное применение Договора об учреждении Евразийского экономического сообщества от 10 октября 2000 года, других действующих в рамках ЕврАзЭС международных договоров и решений органов ЕврАзЭС.
Юрисдикция Экономического Суда СНГ распространяется на межгосударственные споры экономического характера, возникающие:
при применении Договора об учреждении Евразийского экономического сообщества от 10 октября 2000 года и других действующих международных договоров в рамках Евразийского экономического сообщества и принятых органами Евразийского экономического сообщества решений;
при исполнении обязательств, предусмотренных действующими международными договорами в рамках Евразийского экономического сообщества и решениями органов Евразийского экономического сообщества;
К ведению Экономического Суда СНГ могут быть отнесены иные споры, предусмотренные действующими международными договорами в рамках Евразийского экономического сообщества.
Споры в Экономическом Суде СНГ рассматриваются по заявлению заинтересованных государств-членов Евразийского экономического сообщества в лице их правительств.
Экономический Суд СНГ осуществляет толкование положений действующих международных договоров в рамках Евразийского экономического сообщества и решений органов Евразийского экономического сообщества, а также при принятии решений по конкретным делам.
Толкование Экономическим Судом СНГ осуществляется по запросам государств-членов Евразийского экономического сообщества, Межгосударственного Совета, Межпарламентской Ассамблеи и Интеграционного Комитета Евразийского экономического сообщества.
Соглашением предусмотрены некоторые изъятия по принятию решений по спорам, предусмотренные Регламентом Экономического Суда СНГ. Решение по спорам считается принятым, если за него проголосовало не менее двух третей от общего числа назначенных и приступивших к исполнению своих обязанностей судей Экономического Суда СНГ. По результатам рассмотрения спора Экономический Суд СНГ принимает решение, в котором рекомендует меры для его исполнения. Решения Экономического Суда СНГ являются окончательными, а каждое государство-член Евразийского экономического сообщества обязуется выполнять решение Экономического Суда СНГ по тому делу, в котором оно является стороной.
В настоящее время в Евразийском экономическом сообществе действует ряд договоров, содержащих оговорки, предусматривающие юрисдикцию Суда ЕврАзЭС.